蒙药研发国家地方联合工程中心（简称“中心”）是由国家发展改革委员会批准成立的国家级重点实验室，是目前全国唯一一所蒙药国家级实验室。目前“中心”拥有科研人员62人，学科梯队中国务院特贴专家3名、草原英才4名、自治区名师1名、教授16名、副教授11名、讲师13名，博士生导师12名，硕士生导师15名。“中心”场地面积6000平方米，仪器设备总值达4000万元。拥有核磁共振仪、液质联用仪、气质联用仪等大型仪器设备100余台套，能够完成蒙药配伍规律研究、蒙药提取制备工艺、质量标准、稳定性研究、蒙药药理及安全性评价等工作。“中心”近几年承担各级各类科研项目近90余项，包括国家自然科学基金项目16项，国家十二五科技支撑计划项目（课题）4项，973前期专项1项，科技部新药创制课题，内蒙古自治区蒙医药重大科技专项1项。“中心”蒙药研究水平居国内领先，有些领域居国际先进。

“中心”充分发挥理论优势与技术优势，形成了蒙药有效物质基础及安全性评价研究、蒙药新药及保健品的研发、蒙药产业化关键技术、蒙药科技支撑体系建设及蒙医药国际化研究等稳定的研究方向。“中心”将传统蒙医药理论和现代药学理论相结合，将传统工艺与现代科技手段相结合，在继承中创新，在探索中发展，研发出一批高效低毒的新型蒙药制药。针对蒙药发展过程中重大理论问题和蒙药生产过程中共性关键问题，深入开展蒙药基础研究，研发出5个蒙药新药获得临床批件并正在进行临床研究。与蒙药企业合作开展“蒙药水丸包衣关键技术研究”等研究项目，攻破了多项蒙药生产中技术难关。通过研究成果的推广应用，提升了蒙医药研发工程技术的水平,推动了蒙医药传统产业的升级改造，取得了显著的经济效益和社会效益。