| 序号 | 学科名称 | 级别 | 获批年份 |
| 1 | 世界史 | 自治区重点学科 | 1985 |
| 2 | 民族医学（蒙医学） | 自治区重点学科 | 1985 |
| 3 | 理论物理 | 自治区重点学科 | 1994 |
| 4 | 中药学（蒙药学） | 自治区重点学科 | 2008 |
| 5 | 马克思主义中国化研究 | 自治区重点学科 | 2008 |
| 6 | 中国少数民族语言文学 | 自治区重点培育学科 | 2008 |
| 7 | 预防兽医学 | 自治区重点培育学科 | 2008 |
| 8 | 作物栽培学与耕作学 | 自治区重点培育学科 | 2008 |
| 9 | 语言学及应用语言学 | 国家民委重点学科 | 2014 |
| 10 | 中西医结合基础 | 国家民委重点学科 | 2014 |
| 11 | 作物学（一级） | 国家民委重点学科 | 2019 |
| 12 | 民族学（一级） | 国家民委重点学科 | 2019 |
| 13 | 化学（一级） | 国家民委重点建设学科 | 2014 |
| 14 | 蒙药学（生药） | 中医药管理局重点学科 | 2004 |
| 15 | 蒙医学 | 中医药管理局重点学科 | 2012 |
| 16 | 蒙西医结合临床 | 中医药管理局重点学科 | 2012 |